Наука та технологіїкоронавірус

Точний діагноз стосовно коронавірусу може дати тільки ПЛР-тест - генетик

12:59 04 кві 2020.  1013Читайте на: УКРРУС

Вірус має високий мутагенний ефект і вірулентність через регулюючу частину у його генокоді.

Так звані експрес-тести на коронавірус, що показують результат через 5 хвилин, через 20 хвилин або через півгодини, не можуть застосовуватися для діагностики безсимптомних пацієнтів і тих, хто міг заразитися тільки недавно. Такі "швидкі" тести засновані на пошуку антитіл до вірусу, а вони виробляються, коли людина вже одужує або, щонайменше, хвороба вже почалася. Такий експрес-тест може бути квазінегатівним до того часу, як в організмі з'являться антитіла. Його ефективність залежить і від того, в якому стані у людини імунна система і як вона справляється з виробництвом антитіл, пише Радіо Свобода. 

Якщо пацієнт проходить деякі форми імунотерапії або у нього просто ослаблений імунітет, то тест може виявитися неефективним. 

Експрес-тести можуть бути дешевим і хорошим способом виявлення інфекції, але вони вимірюють відповідь організму на хворобу, що вже розвинулася, і не годиться для ранньої діагностики і для діагностики людей, які не хворіють самі, але є рознощиками інфекції. 

А ось інший вид тесту - ПЛР (використовує полімеразну ланцюгову реакцію) принципово відрізняється від експрес-тестів і заснований на прямому виявленні РНК вірусу. Це як раз той тест, який повинен застосовуватися при тестуванні населення, щоб знайти рознощиків вірусу і зупинити епідемію, каже чеський молекулярний генетик і вірусолог Соня Пекова, яка очолює лабораторію Tilia Laboratories, що діагностувала одні з перших в Чехії випадків коронавіруса. Зазначимо при цьому, що Чехії вдалося досягти відносного успіху у протидії Covid-19. 

За словами пекові, вірус SARS-CоV-2, як з'ясувалося, поводиться вкрай незвично. У нього велика здатність до мутацій. При мутації можуть змінюватися ділянки геному, на які початково націлений перший тест. SARS-CоV-2 відрізняється від "звичайних" коронавірусів насамперед нетрансльованою регулюючою областю (частина генетичного коду, яка не відповідає безпосередньо за синтез білків). 

У ній є послідовності генів, що сильно відрізняються від послідовностей в регулюючій області коронавіруса, який живе на кажанах, притому що "тіло" вірусу, його структурні гени є такими ж, як у вірусу кажанів. У цього нового вірусу людини регулююча область нібито трохи змінена, що може бути пов'язано і з його дуже високою здатністю до розмноження. Саме через те, що вірус так швидко розмножується, він так заразний. 

З цим же, ймовірно, пов'язана і його висока здатність до мутацій - дуже швидко з'являються штами, яких раніше не бачили. 

Тому чеська біолог не виключає, що нинішній вірус може мати штучне походження. "Він веде себе дуже незвично. В світі є кінцева кількість вірусів, що заражають людей. Ми зазвичай можемо за симптомами хвороби приблизно вгадати, який вірус її викликає. Звичайно, не на 100%, але ми можемо сказати: якщо симптоми виглядають ось так, то це, швидше за все, якийсь із вірусів грипу, коли пронос - інший тип вірусу, коли висип - ми шукаємо герпесвіруси. Тому, коли ми знаємо, що хвороба викликається коронавірусом, у неї буде певний перебіг. Але у цього коронавіруса зовсім інша картина, це як ніби новий тип хвороби ", - цитує Пекову "Радіо Свобода". 

"Коли клінічна картина вірусу настільки відрізняється від інших вірусів того ж типу, це як мінімум дивно. Що стосується його генокоду - я багато років присвятила молекулярній біології і генетиці, займалася клонуванням і використовувала різні частини вірусів для генної інженерії - це дуже поширена практика. Коли я побачила цю послідовність (в регулюючій області), мені відразу здалося, що вона не дуже схожа на природну", - зазначає генетик. 

Коментуючи статтю американських вчених в журналі Nature Medicine, в якій стверджується, що штучне походження цього вірусу повністю виключено, Пекова зазначила, що в ній йшлося тільки про структурні гени цього вірусу і там жодним словом не згадується про його регулюючу область. 

"Якби ми говорили тільки про структурні гени, я б не думала, що з цим вірусом щось не так. Але потрібно дивитися на весь геном, не виключаючи з розгляду інші його частини, і, можливо, там ми знайдемо відповідь .. . Мені здається, що зміна в генокоді цього вірусу знаходиться якраз в цій регулюючій області", - говорить чеський генетик.

Читайте також: В Україні почнеться серійне виробництво тестів на коронавірус

Фото: NEWSru.com 

 

Ірина Костюченко

Новини

Найпопулярніше